MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Desulfotomaculum reducens MI-1 chromosome

Total Repeats: 74300

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_009253	TAT	2	6	172	177	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_009253	TAA	2	6	257	262	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_009253	ATT	2	6	281	286	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_009253	TTA	3	9	305	313	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_009253	T	7	7	319	325	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_009253	AGT	2	6	338	343	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7	NC_009253	ATG	2	6	372	377	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	134297882
8	NC_009253	TAA	2	6	424	429	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	134297882
9	NC_009253	ATA	2	6	480	485	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	134297882
10	NC_009253	ATT	2	6	488	493	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	134297882
11	NC_009253	TGGC	2	8	524	531	0 %	25 %	50 %	25 %	134297882
12	NC_009253	TAT	2	6	547	552	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	134297882
13	NC_009253	TAT	2	6	571	576	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	134297882
14	NC_009253	GA	3	6	641	646	50 %	0 %	50 %	0 %	134297882
15	NC_009253	GAA	2	6	653	658	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	134297882
16	NC_009253	TGC	2	6	733	738	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	134297882
17	NC_009253	ATT	2	6	781	786	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	134297882
18	NC_009253	GGT	2	6	794	799	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	134297882
19	NC_009253	ATGC	2	8	824	831	25 %	25 %	25 %	25 %	134297882
20	NC_009253	TCAAT	2	10	912	921	40 %	40 %	0 %	20 %	134297882
21	NC_009253	GAT	2	6	926	931	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	134297882
22	NC_009253	GTA	2	6	960	965	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	134297882
23	NC_009253	GAC	2	6	983	988	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	134297882
24	NC_009253	A	6	6	1004	1009	100 %	0 %	0 %	0 %	134297882
25	NC_009253	GAAC	2	8	1010	1017	50 %	0 %	25 %	25 %	134297882
26	NC_009253	GAA	2	6	1022	1027	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	134297882
27	NC_009253	AAT	2	6	1069	1074	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	134297882
28	NC_009253	TCC	2	6	1090	1095	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	134297882
29	NC_009253	TAA	2	6	1149	1154	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	134297882
30	NC_009253	TGA	2	6	1237	1242	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	134297882
31	NC_009253	ATTA	2	8	1300	1307	50 %	50 %	0 %	0 %	134297882
32	NC_009253	TTC	2	6	1321	1326	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	134297882
33	NC_009253	GCTG	2	8	1354	1361	0 %	25 %	50 %	25 %	134297882
34	NC_009253	ATT	2	6	1403	1408	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	134297882
35	NC_009253	TAA	2	6	1419	1424	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	134297882
36	NC_009253	A	6	6	1474	1479	100 %	0 %	0 %	0 %	134297882
37	NC_009253	ACTG	2	8	1534	1541	25 %	25 %	25 %	25 %	134297882
38	NC_009253	TGA	2	6	1564	1569	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	134297882
39	NC_009253	TGG	2	6	1573	1578	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	134297882
40	NC_009253	TTC	2	6	1644	1649	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	134297882
41	NC_009253	A	7	7	1669	1675	100 %	0 %	0 %	0 %	134297882
42	NC_009253	AAT	2	6	1686	1691	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	134297882
43	NC_009253	AAC	2	6	1852	1857	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
44	NC_009253	TTA	2	6	1860	1865	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_009253	CTA	3	9	1866	1874	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
46	NC_009253	A	6	6	1879	1884	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_009253	A	6	6	1890	1895	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_009253	AAT	2	6	1928	1933	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	134297883
49	NC_009253	ACT	2	6	1965	1970	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	134297883
50	NC_009253	ATA	2	6	2038	2043	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	134297883
51	NC_009253	GCAA	2	8	2054	2061	50 %	0 %	25 %	25 %	134297883
52	NC_009253	TGT	2	6	2087	2092	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	134297883
53	NC_009253	CACAA	2	10	2099	2108	60 %	0 %	0 %	40 %	134297883
54	NC_009253	TATTG	2	10	2120	2129	20 %	60 %	20 %	0 %	134297883
55	NC_009253	AAG	2	6	2156	2161	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	134297883
56	NC_009253	AATCA	2	10	2188	2197	60 %	20 %	0 %	20 %	134297883
57	NC_009253	TAA	2	6	2209	2214	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	134297883
58	NC_009253	GAA	3	9	2313	2321	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	134297883
59	NC_009253	ACA	2	6	2430	2435	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	134297883
60	NC_009253	ATT	2	6	2496	2501	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	134297883
61	NC_009253	TGC	2	6	2543	2548	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	134297883
62	NC_009253	CAA	2	6	2553	2558	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	134297883
63	NC_009253	AAT	2	6	2585	2590	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	134297883
64	NC_009253	GGA	2	6	2600	2605	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	134297883
65	NC_009253	CTA	2	6	2610	2615	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	134297883
66	NC_009253	TTG	2	6	2733	2738	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	134297883
67	NC_009253	ATT	2	6	2757	2762	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	134297883
68	NC_009253	GAA	3	9	2775	2783	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	134297883
69	NC_009253	A	6	6	2782	2787	100 %	0 %	0 %	0 %	134297883
70	NC_009253	GTAG	2	8	2811	2818	25 %	25 %	50 %	0 %	134297883
71	NC_009253	TTTA	2	8	2839	2846	25 %	75 %	0 %	0 %	134297883
72	NC_009253	TC	3	6	2856	2861	0 %	50 %	0 %	50 %	134297883
73	NC_009253	ATA	2	6	2917	2922	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	134297883
74	NC_009253	TA	3	6	2921	2926	50 %	50 %	0 %	0 %	134297883
75	NC_009253	TGA	2	6	2978	2983	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	134297883
76	NC_009253	AAC	2	6	3011	3016	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	134297883
77	NC_009253	GA	3	6	3022	3027	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
78	NC_009253	TAAA	2	8	3052	3059	75 %	25 %	0 %	0 %	134297884
79	NC_009253	TGG	2	6	3107	3112	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	134297884
80	NC_009253	A	6	6	3180	3185	100 %	0 %	0 %	0 %	134297884
81	NC_009253	T	6	6	3227	3232	0 %	100 %	0 %	0 %	134297884
82	NC_009253	TGTGA	2	10	3236	3245	20 %	40 %	40 %	0 %	134297884
83	NC_009253	A	6	6	3264	3269	100 %	0 %	0 %	0 %	134297885
84	NC_009253	AAG	2	6	3299	3304	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	134297885
85	NC_009253	TATT	2	8	3381	3388	25 %	75 %	0 %	0 %	134297885
86	NC_009253	TCT	2	6	3484	3489	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	134297885
87	NC_009253	GATT	2	8	3491	3498	25 %	50 %	25 %	0 %	134297885
88	NC_009253	GTA	2	6	3524	3529	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	134297885
89	NC_009253	AG	3	6	3552	3557	50 %	0 %	50 %	0 %	134297885
90	NC_009253	CTCG	2	8	3560	3567	0 %	25 %	25 %	50 %	134297885
91	NC_009253	AGA	2	6	3603	3608	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	134297885
92	NC_009253	TAA	2	6	3617	3622	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	134297885
93	NC_009253	AAG	2	6	3639	3644	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	134297885
94	NC_009253	GAAA	2	8	3741	3748	75 %	0 %	25 %	0 %	134297885
95	NC_009253	AAC	2	6	3794	3799	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	134297885
96	NC_009253	A	7	7	3846	3852	100 %	0 %	0 %	0 %	134297885
97	NC_009253	GGA	2	6	3892	3897	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	134297885
98	NC_009253	GAA	2	6	3901	3906	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	134297885
99	NC_009253	T	6	6	3974	3979	0 %	100 %	0 %	0 %	134297885
100	NC_009253	CAT	2	6	3980	3985	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	134297885
101	NC_009253	A	7	7	3991	3997	100 %	0 %	0 %	0 %	134297885
102	NC_009253	GAT	2	6	4048	4053	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	134297885
103	NC_009253	GCA	2	6	4104	4109	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	134297885
104	NC_009253	TAC	2	6	4184	4189	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	134297885
105	NC_009253	TGAT	2	8	4235	4242	25 %	50 %	25 %	0 %	134297885
106	NC_009253	AAC	2	6	4272	4277	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	134297885
107	NC_009253	GGT	2	6	4288	4293	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	134297885
108	NC_009253	GAA	2	6	4297	4302	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	134297885
109	NC_009253	CTC	2	6	4321	4326	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	134297885
110	NC_009253	AGG	2	6	4358	4363	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	134297885
111	NC_009253	GTA	2	6	4395	4400	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	134297886
112	NC_009253	A	7	7	4406	4412	100 %	0 %	0 %	0 %	134297886
113	NC_009253	CAC	2	6	4577	4582	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	134297886
114	NC_009253	A	6	6	4586	4591	100 %	0 %	0 %	0 %	134297886
115	NC_009253	A	6	6	4633	4638	100 %	0 %	0 %	0 %	134297886
116	NC_009253	T	7	7	4652	4658	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_009253	A	6	6	4672	4677	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_009253	CAG	3	9	4817	4825	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	134297887
119	NC_009253	AAT	2	6	4826	4831	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	134297887
120	NC_009253	GTA	2	6	4905	4910	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	134297887
121	NC_009253	CAT	2	6	4928	4933	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	134297887
122	NC_009253	TGA	2	6	4963	4968	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	134297887
123	NC_009253	ATT	2	6	4994	4999	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	134297887
124	NC_009253	CTG	2	6	5085	5090	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	134297887
125	NC_009253	TGC	2	6	5109	5114	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	134297887
126	NC_009253	GTG	2	6	5136	5141	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	134297887
127	NC_009253	AAC	2	6	5302	5307	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	134297887
128	NC_009253	TAAA	2	8	5406	5413	75 %	25 %	0 %	0 %	134297887
129	NC_009253	AAAAG	2	10	5438	5447	80 %	0 %	20 %	0 %	134297887
130	NC_009253	AC	3	6	5530	5535	50 %	0 %	0 %	50 %	134297887
131	NC_009253	GTT	2	6	5573	5578	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	134297887
132	NC_009253	CA	3	6	5642	5647	50 %	0 %	0 %	50 %	134297887
133	NC_009253	CGG	2	6	5653	5658	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	134297887
134	NC_009253	A	6	6	5731	5736	100 %	0 %	0 %	0 %	134297887
135	NC_009253	CAAA	2	8	5825	5832	75 %	0 %	0 %	25 %	134297887
136	NC_009253	A	7	7	5927	5933	100 %	0 %	0 %	0 %	134297887
137	NC_009253	GGCCAG	2	12	5956	5967	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	134297887
138	NC_009253	AGC	2	6	5971	5976	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	134297887
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263	NC_009253	AT	3	6	11823	11828	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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266	NC_009253	AAGA	2	8	12070	12077	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
267	NC_009253	GAA	2	6	12113	12118	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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270	NC_009253	AGG	2	6	12240	12245	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
271	NC_009253	GGA	2	6	12277	12282	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
272	NC_009253	AGAA	2	8	12285	12292	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
273	NC_009253	GCG	2	6	12311	12316	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
274	NC_009253	TTC	2	6	12345	12350	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
275	NC_009253	TCA	2	6	12374	12379	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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277	NC_009253	G	6	6	12512	12517	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
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